電子顯微鏡室應按所用設備的允許振動速度和防磁要求，遠離振動源及磁場干擾源布置，且宜布置在建筑物的底層。

　　電鏡基座應采取隔振措施。與電鏡配套使用的有振動的輔助設備及室內空氣調節設備等，應設隔振裝置。

　　電子顯微鏡室由電鏡間、過渡間、準備間、切片間、涂膜間及暗室組成。過渡間面積不應小于6m2，且應設更衣柜及換鞋柜。

　　電鏡間設計不宜設外窗。

　　電鏡間的室內凈高應按設備高度及檢修要求確定。

　　電鏡間、切片間及涂膜間的空氣應過濾。人員出入口必須設更衣柜及換鞋柜。