出入境檢驗檢疫中心主要從事進出口植物及其產品、動物及其產品、農產品、食品、石油及其產品、礦產品、化工品、煤炭、金屬材料、包裝及危險品的檢測、分類和鑒定工作，大致可以分為以下幾個實驗室，如：植物檢疫、動物檢疫、食品微生物、分子生物學、食品理化、農殘、獸殘、毒理、礦產品、石油化工、危險品、電子電器等等的實驗室。

　　在中國標準分類中，出入境實驗室涉及到標準化、質量管理、動物檢疫、獸醫與疫病防治、衛生檢疫。通常包含微生物實驗室規劃設計、病毒實驗室規劃設計、化學實驗室規劃設計、食品檢驗檢測實驗室規劃設計、病毒學實驗室規劃設計等等

　　一、病毒學實驗室

　　1.功能：對病毒病流行情況進行檢測、處理上報和專項分析，主要進行病毒流行病學、分子生物學、病毒培養分離檢定、病毒病原學、免疫學等方面研究，為病毒病預防與控制提供科學的實驗室數據，對轄下實驗室建設方案進行技術指導與支持。

　　2.功能組設置：

　　(1)病毒培養實驗室

　　功能：進行病毒分離培養及鑒定

　　具備的檢驗能力：流感病毒分離鑒定、脊灰病毒分離鑒定及中和抗體測定、脊灰糖丸效價測定、麻疹疫苗效價測定等

　　分兩區：A、腸道病毒培養區 B、呼吸道病毒培養區(P2設計)

　　所要添置的主要設備：倒置顯微鏡、熒光顯微鏡、超低溫冰箱、液氮罐、二氧化碳培養箱2臺、普通培養箱、水浴箱、二級生物安全柜2臺、臺式低溫高速離心機、臺式普通離心機、全自動高壓消毒器、電鏡(發展方向)等。

　　(2)病毒免疫學實驗室(P2設計)

　　功能：病毒免疫學檢測

　　具備的檢測能力：酶免試驗、血凝、血抑試驗、簡介免疫熒光試驗、凝集試驗、中和試驗、補體結合試驗等

　　所要添置的主要設備：熒光顯微鏡、超低溫冰箱、普通培養箱、水浴箱、二級生物安全柜1臺、酶標儀、洗板機、臺式低溫高速離心機、臺式普通離心機、全自動高壓消毒器等。

　　(3)HIV實驗室

　　功能：艾滋病初篩、確認

　　具備檢驗項目：酶免試驗、蛋白印跡試驗、凝集試驗、金標(硒標)快速檢測;

　　發展方向：核酸分析、抗原檢測、HIV相關免疫因子檢測、病毒載量檢測

　　所要添置的主要設備：酶標儀、洗板機、全自動蛋白印跡儀、生物安全柜、低溫冰箱、普通培養箱、全自動高壓消毒器、數碼相機、流式細胞儀(預留發展)等。

　　(4)生化免疫實驗室(肝炎室)

　　功能：進行肝炎病毒免疫學分析及生化分析

　　分兩區：A.酶免檢測區 B.生化分析區 C.時間分辨免疫檢測

　　所要添置的主要設備：全自動生化儀、全自動酶標儀、時間分辨檢測儀等。

　　二、分子生物學實驗室(P2設計)

　　1.功能：進行分子生物學方面研究

　　2.分四區：A、試劑準備區 B、樣品處理區 C、擴增區 D、產物分析區

　　3.發展方向：基因芯片檢測、DNA測序

　　4.所要添置的主要設備：普通擴增儀、實時PCR儀、凝膠產物分析系統、分子成像系統、臺式低溫高速離心機、高速離心機3臺、普通培養箱、二級生物安全柜1臺、超凈工作臺1臺、全自動高壓消毒器、DNA測序儀(預留發展)等。

　　三、細菌學實驗室

　　1、功能：細菌分析鑒定、細菌衛生指標檢測等，為疫情處理提供細菌學檢測指標，為下級單位提供技術指導及支持。

　　2、功能組設置：

　　(1)病原細菌室

　　功能：進行病原細菌培養及分離鑒定

　　分兩區：A、腸道細菌培養區 B、呼吸道細菌培養區(P2設計)

　　所要添置的主要設備：全自動細菌鑒定儀、細菌免疫分析儀、超低溫冰箱、普通顯微鏡、熒光顯微鏡、生化培養箱一批、厭氧培養箱、二氧化碳培養箱、二級生物安全柜1臺、離心機、全自動高壓消毒器等。

　　(2)衛生細菌室

　　功能：相關產品細菌學指標檢測、鑒定

　　分區：A、1000級實驗室2間 B、100級實驗室1間

　　所要添置的主要設備：全自動菌落計數儀、普通顯微鏡、全自動細菌鑒定儀(與病原細菌室共用)、細菌免疫分析儀(與病原細菌室共用)、普通顯微鏡、熒光顯微鏡(與病原細菌室共用)、生化培養箱一批、厭氧培養箱、霉菌培養箱、全自動高壓消毒器等。

　　四、其他實驗室

　　1、寄生蟲病實驗室

　　功能：糞便檢查、血液檢、寄生蟲培養、免疫學試驗

　　發展方向：食品衛生及生產檢驗、動物實驗

　　所要添置的儀器設備：普通顯微鏡、熒光相差顯微鏡、酶標儀、洗板機等、

　　2、毒理學實驗室

　　功能：記性毒性試驗(經皮、經消化道、呼吸道)、眼刺激試驗、皮膚刺激試驗、粘膜刺激試驗。

　　發展方向：致癌致畸試驗、慢性毒性試驗、營養指標毒理試驗

　　分區：A、動物房 B、實驗區

　　需要添置的儀器：冷凍切片機、顯微鏡、電子天平等。

　　3、抗性實驗室

　　功能：“四害”抗藥性試驗

　　分區：A、動物房(按普通級動物房設計) B、實驗區

　　需要添置的儀器：顯微鏡、電子天平等、毒氣櫥等。

　　4、P3實驗室(預留發展)

　　主要功能：高傳染性病原體實驗室檢測

　　五、實驗室配套室間及設施

　　1、辦公區域房間配置若干

　　2、試劑貯存、培養基制設備室1間

　　3、細菌組儀器室1間

　　4、純水制備室1間

　　5、供應室1間