PCR實驗室檢測的核心問題是避免污染，極其微量的污染就造成假陽性的檢測結果。

      與通風相關的常見污染有以下幾種類型:V區擴增產物氣溶膠逸出并進入工~Ⅲ區對試劑、標的污染;I~Ⅲ區試劑使用過程的污染;標本制備時遭受的污染。

      針對這些潛在的污染，通風控制策略如下:

　　(1)Ⅳ區必須為負壓，三分區情況則Ⅲ區必須為負壓;

　　(2)I~Ⅲ區相對Ⅳ區必須正壓，Ⅱ區壓力*高，必須確保Ⅱ區氣流向外;

　　(3)Ⅱ區純化操作時標本暴露受污染可能性*大，必須在生物安全柜內操作;

　　(4)試劑操作必須在潔凈臺內進行;

　　(5)緩沖間的屏障作用必須設置。

　　PCR實驗室各房間溫濕度為舒適性要求。但是Ⅱ區較為特殊，工作人員操作時注意力集中且穿戴實驗服、口罩、護目鏡等，不利于散熱，因此室內設計溫度按 22~24℃為宜。暖通設計*為關鍵的是控制各房間的相對壓力關系。關于緩沖間的壓力和是否送排風問題，我們技術認為，經過緩沖間，已經大大降低房間與外界的空氣交換，從而降低標本受污染的風險，因此緩沖間可不設送排風，對壓力也不做要求。

　　有的工程設計中PCR實驗室采用了潔凈空調系統，甚至采用全新風潔凈空調系統，筆者以為這些做法可能存在過度凈化的問題。只要操作人員按照實驗標準程序操作，嚴格執行實驗室工作制度，系統運行中房間之間壓力關系得以維持，通風策略(見以上(1)~(5)條)得到正確實施，那么實驗遭受污染的可能性就很小，在此基礎上，潔凈空調系統并不能對降低污染起明顯改善作用，反而使得建設成本、運行成本提高不少。因此，不建議采用潔凈空調系統。雖然如此，仍需強調新風過濾處理(詳情可聯系咨詢我們)應滿足末級*低高中效過濾要求，這與 ASHRAE 標準及手冊中關于實驗室末級過濾 MERV13的要求也是吻合的。

　　PCR實驗室新風換氣次數可按3h-1計算，Ⅱ區應設置獨立的生物安全柜補風系統補風量可按安全柜排風量取值，并與生物安全柜連鎖啟停，由于生物安全柜的運行一般需提前和延遲于實驗操作，因此補風系統與生物安全柜不需要設置先后啟停順序。